1990年1月22日，經國務院批準，霸縣改設霸州市，為省轄縣級市，由廊坊市管理。行政區劃未變。

1992年11月，經省政府批準從霸州鎮劃出付莊、宋莊、小何莊，從臨津鄉劃出大何莊、北燕家務北頭村、北燕家務南頭村等6個行政村，成立霸州市省級火炬產業園區。1996年9月，改稱霸州經濟技術開發區。

1996年4月，按照河北省指示并鄉擴鎮，老堤鄉與霸州鎮合并為霸州鎮。臨津鄉與岔河集鄉合并為岔河集鄉。辛店鄉與康仙莊鄉合并為康仙莊鄉。中口鄉與信安鎮合并為信安鎮。辛章鄉與東段鄉合并為東段鄉。褚河港鄉與揚芬港鄉合并為揚芬港鄉。霸州市轄 12個鄉鎮。即霸州鎮、南孟鎮、煎茶鋪鎮、信安鎮、堂二里鎮、勝芳鎮、岔河集鄉、康仙莊鄉、東楊莊鄉、王莊子鄉、東段鄉、揚芬港鄉。

同年7月，霸州市成立城區辦事處。從霸州鎮轄區劃出城五街、城六街、北關、朱莊、迎恩、馮莊、掛甲莊、孟家墳、范家坊、大魏營、小魏營11個村街，從康仙莊鄉劃出北楊鄉莊村和市區內的康復道、建設道、興建街、文苑里4個居委會，組成城區辦事處。

1998年9月，與東段鄉合并的辛章鄉從東段鄉析出，成立辛章辦事處。至2003年，霸州市共轄6個鎮，6個鄉，1個開發區，2個辦事處。即：霸州鎮、勝芳鎮、南孟鎮、煎茶鋪鎮、信安鎮、堂二里鎮、岔河集鄉、康仙莊鄉、東楊莊鄉、王莊子鄉、東段鄉、揚芬港鄉、霸州經濟技術開發區、城區辦事處，辛章辦事處。（《霸州市志》2006年版）