報告題目:Multi-scale modeling of 3-D chromatin structures
報 告 人 :高毅勤教授
報告時間:2018年1月17日(周三)上午9:00
報告地點:化學樓一號會議室
邀 請 人:楊利明教授
報告人簡介:
高毅勤,北京分子科學國家研究中心副主任。北京大學化學與分子工程學院院長,教育部“長江學者”特聘教授,北京大學生物動態光學成像中心研究員,國家杰出青年科學基金獲得者。1993年本科畢業于四川大學化學系,1996年在中科院化學所獲得碩士學位, 2001年獲得加州理工學院博士學位。2001年-2004年間在加州理工學院和哈佛大學做博士后研究。2005年-2009年,美國得克薩斯農工大學化學系助理教授。2010-現今,北京大學化學與分子工程學院教授。他的研究領域是理論和計算化學。致力于發展理論與計算方法研究染色質結構和生物功能,生物分子的溶液構象,生物酶催化機制和化學反應中的溶劑化效應。已在Science, Cell, PNAS, JACS等雜志發表SCI論文100余篇。在國際和國內學術會議上和科研機構做大會和邀請報告150余次。曾獲Pople Medal, 日本化學會Keynote Lecturer獎,美國Searle Scholar,Dreyfus新教授獎和Clauser Prize等。擔任ACS Central Science, Chemistry of Materials, Journal of Chemical Physics,Interdisciplinary Sciences, 物理化學學報等期刊的編委。
報告摘要:
Chromosome structure is essential in many biological studies. Recent Hi-C experimental studies have been dramatically deepening our understanding of the 3D chromatin. In this talk, we describe the modelling of the chromatin structure utilizing experimental Hi-C data, which provides the spatial details of chromatin. By mapping a plethora of genome features onto the chromatin model, we quantitatively and systematically reinforce the importance of chromatin architecture for genome function. We find that the colocalization of genome features on a linear map coincides their 3D segregation, and thus the latter provides a mechanism for the regulation of various genome properties. Especially, we will discuss the effects of DNA methylation on the structure of DNA and that the overall DNA methylation patter reflects the 3-D organization of the human chromatin.